组织运行方式：

（1）重点实验室实行学术委员会领导下的主任负责制。重点实验室设主任1名，副主任4名，主任由清华大学推荐、报教育部批准任命。主任负责实验室日常学术活动、行政管理、梯队建设、资源管理等的全面工作，副主任协助主任负责实验室的具体的工作。
（2）重点实验室下设办公室，其主要职责是处理实验室日常行政事务，负责实验室科研项目的管理。办公室设专职秘书1名，由实验室主任任命。
（3）重点实验室学术委员会指导实验室的工作、审议实验室的目标、任务和研究方向，审议实验室的重大学术活动、年度工作，审批开放基金课题等。学术委员会每年召开一次会议，听取实验室主任作实验室的工作报告。

实验室管理人员：